Sorunu çözemediğim için kızıp .vdi dosyasını sildim :( Herhangi bir hata çıkınca freebsd 11.3 mysql 5.6 sürümlerinde çalıştığım için uyumlulukta sorun çıktığını düşünüyorum. Çünkü forumlardaki tüm server fileslar freebsd 9.2 sürümü mysql 5.5'te sorunsuz çalışıyor. Keşke silmeseydim :(:(