DLL dosyalarını %100 sağlıklı bir şekilde projeye gömmek için hepsinin kaynak koduna erişimin olması gerekir. Aksi halde kaynak kodlarından bunu yapamazsın. Bunun haricinde exe klasörünün içine bir klasör oluşturup dll dosyalarını içine atabilirsin. Ama bunun için visual studio üzerinden ayarlar...