Tuhaf bir sorun. Önerebileceğim şeyler şunlar açıkcası;
Yedekleri tamamen yüklediğinizden ve tamamen işlemleri geri aldığınızdan emin olun.
gmake dep yapmadan gmake clean + gmake şeklinde derlemeyi deneyin.
Eğer yedekleriniz sadece ilgili .cpp dosyalarıysa, gmake clean çekip .cppleri tekrar...